河南省医药专科学校机构设置：

学校设有党委办公室、组织部、宣传部、离退休职工工作处、纪委、工会、团委等6个群团组织医学教育网|搜集整理；校长办公室、人事处、教务处、学生处、实验设备处、计财处、基建处、总务处、保卫处、对外交流合作处、科研处、招生办、审计处等13个行政机构；临床医学、中医系、针灸骨伤系、护理系、医学技术系、卫生管理系、继续教育学院、政治理论教学部、基础医学部、公共教学部、体育教学部、中专部等13个教学部系。学校开设临床医学、中医医疗、中西医结合、中药、中医骨伤、针灸推拿、护理、医学影像、药学、眼视光技术等普通专科专业和五年制、对口升学等升段专科。过渡期内保留中专部，开设医、药、护、技等23个专业。