新疆中医药大学中医系：

1946年，在新疆“三区”革命时期建立伊犁医士学校。

1954年，原伊犁医士学校更名为新疆乌鲁木齐卫生学校。

1961年4月，经自治区党委文教部批准，将乌鲁木齐市卫生学校改制成立新疆维吾尔自治区中医学校，设有中医、中药、药剂三个专业。1978年开始招收大专生和本科生。

1985年、1986年先后经国家教委和自治区人民政府批准，在原中医学校、自治区中医医院和自治区中医研究所的基础上成立新疆中医学院，1989年4月经自治区编委确定为正厅级单位医学|教育网整理。当时，学院设有中医、中药、针灸三个本科专业和中医、中西医结合、中医骨伤等本科专业方向，并开设中医学、中医高护等专科专业。

1994年新疆中医学院挂靠上海中医药大学与上海中医药大学联合首次招收中医内科、中西医结合内科、针灸和医古文等专业的硕士研究生。