首都医科大学宣武医院科室设置：

医院设有32个中西医临床科室、14个医技科室；还设有7个研究所，1个教育部重点实验室，1个国家重点实验室临床研究与康复基地，1个北京市重点实验室，1个国家中医药管理局三级实验室，8个基础研究室，8个技术与开发平台和4个临床实验室。其中老年神经病学、中西医结合老年神经病学、微侵袭神经外科、神经病理、普通外科、血液科和医学影像为北京市重点学科。拥有PET（正电子断层扫描仪）、磁共振仪、64排螺旋CT、SPECT、双C臂数字减影血管造影仪、彩色多普勒和全自动生化分析仪等高档精密诊疗设备。

本院是首都医科大学的第一临床医学院，首都医科大学护理学院、医学教育网搜集|整理生物医学工程学院也设在这里，承担着大专生、本科生、硕士研究生、博士研究生和博士后的培养任务。