牡丹江医学院药学院始建于2003年，是黑龙江省东南部地区高级药学人才培养基地。下设无机化学与物理化学教研室、有机化学教研室、药理学教研室、天然药物化学与生药学教研室、药物化学教研室、药物分析教研室、药剂学教研室、制药工程教研室及药学实验教学中心。现有制药工程、药学和药物制剂三个本科专业。

现有在编教职工54人，其中教授14人，副教授5人，讲师23人，助教1人，高级实验师1人、实验师6人、助理实验师3人、其他1人。现有博士8人（博士后1人），在读博士2人，硕士28人，在读硕士3人。从1996年开始先后与黑龙江中医药大学、吉林大学、佳木斯大学联合培养硕士研究生，现有8名硕士研究生导师医学教育网编辑整|理。

药学院现有省级重点培育学科1个，校级精品课程2个，校级重点建设课程2个；建有药学实验平台，总面积1700余平方米；46个功能齐全实验室，有液相色谱仪等10万元以上大型仪器设备20余台件。近三年，主持、参与国家自然科学基金项目6项，独立承担黑龙江省自然科学基金项目6项、厅局级科研项目20余项；发表SCI、EI、核心期刊论文三十余篇，教研论文三十余篇，主编专著、教材5部，参编20余部；获各级科研、教研奖励二十余项。牡丹江市北药开发实验基地、黑龙江省教育厅校企共建研发中心设在药学院。

药学院将继续抓紧机遇，加快发展，与时俱进，开拓创新，努力把药学院建设成为培养全方位、高素质药学人才的重要教学基地，力争在教育质量、科学研究、学科建设、管理水平等方面取得新的更大的进步。