1、颅内肿瘤

脑包虫病所致的颅内压增高和定位症状与颅内肿瘤相似，常误诊为颅内肿瘤而手术，故对来自流行区有颅内压增高的病人，应高度警惕，须作详细而全面的体检，特别注意是否伴有肝脏或肺脏包虫，必要时作包虫卡松尼皮内试验和各种免疫学检查，CT及MRI检查可以确诊。

2、颅内蛛网膜囊肿

其一般认为是胚胎期蛛网膜发育不良所致，在儿童和青壮年中发病率高，常好发于脑池相关部位，如侧裂池等。CT和MRI检查表现为边界光滑的低密度、低信号囊性病变，密度或信号与脑脊液相同，无钙化，囊内长T1长T2无强化。

3、脑部其他寄生虫病

①脑囊虫病

与脑包虫病具有共同的临床症状如颅内压增高、癫痫发作和定位体征等，但囊虫病可伴有皮下结节，切取后镜检可明确诊断。脑CT及MRI对绝大部分囊肿能作出准确的诊断，对于囊泡型脑囊虫，尤其是巨大的单发囊泡型囊虫，因其CT及MRI表现基本一致容易误诊。但囊泡型脑囊虫并有时合并有其他类型的囊虫影像。脑包虫囊肿较脑囊虫囊肿更圆，几成正圆形。术中包虫囊壁呈乳白色、粉皮样，厚约2mm左右，脑囊虫囊泡囊壁菲薄透明。

②脑肺吸虫大都伴有肺部及其他部位的病变，通常腹部症状出现最早，肺部症状次之。从铁锈色痰中找到虫卵和夏克雷登氏结晶，结合肺部X线片，块状典型肺吸虫改变，不难鉴别。

③脑血吸虫病

晚期病人表现为血吸虫性肉芽肿，其反应性广泛性脑水肿。颅内压增高明显，常伴有偏瘫、偏身感觉障碍、失语等定位征象，有类似脑包虫病之处，病人一般来自于流行区，有涉水史，肝及肠道受累显著，粪便沉淀和孵化可查到虫卵和毛蚴。乙状结肠镜检查可见结肠粘膜浅表溃疡、息肉、疤痕等病变，取组织活检，查到虫卵阳性率高。