流行性乙型脑炎鉴别诊断，乙脑需要与下列疾病进行鉴别：

　　1.中毒型菌痢（脑型）：可暂无消化道症状，可有中毒性休克，一般无脑膜刺激征，脑脊液多正常。做肛拭或灌肠检查粪便，可见脓细胞及红细胞，粪便细菌培养阳性可确诊。

　　2.化脓胜脑膜炎：流行性脑脊髓膜炎多发生于冬、春季节，有发热、皮肤淤点、淤斑，脑脊液外观混浊，白细胞＞1000×106／L，以多核细胞为主，蛋白质明显增高，糖与氯化物明显降低，涂片或培养可查见脑膜炎球菌。其他化脓性脑膜炎可根据年龄、原发病灶、脑脊液改变、涂片或培养找到病原菌进行鉴别。

　　3.结核性脑膜炎：无季节性。起病较缓，病程较长，脑膜刺激征明显，意识障碍轻，出现较迟。有结核病史或接触史。脑脊液压力明显升高，外观呈毛玻璃样，细胞数（500～1000）×1O6／L，以单核细胞为主，蛋白质明显增高，糖和氯化物降低，培养可检出结核杆菌。结核菌素试验可阳性。

　　4.其他病毒性脑膜炎：由单纯疱疹病毒、腮腺炎病毒、部分型的柯萨奇病毒和埃可病毒、脊髓灰质炎病毒、淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒等引起，临床症状和乙脑相似，确诊有赖于血清免疫学检查和病毒分离。