口腔溃疡病因不明确，可能的因素如下：

　　1.免疫学异常：复发性口腔溃疡是否存在细胞介导的免疫反应，通常是检查T淋巴细胞的功能。用抗淋巴细胞表面抗原的单克隆抗体研究在溃疡期有大量的CD₈⁺，所以可以认为在溃疡的形成中CD₈⁺起重要的作用。

　　2.消化系统疾病：胃溃疡，十二指肠溃疡，慢性或迁延性肝炎，结肠炎等。

　　3.内分泌变化：有些女性患者往往在月经期发生，可能与体内雌激素量下降有关。

　　4.精神因素：有的患者在精神紧张、情绪波动、睡眠状况不佳的情况下发病，有的与参加考试、精神压力过大有关，与植物神经功能失调有关。

　　5.遗传因素：此病有明显的遗传倾向。如父母双方均医学教育|网搜集整理患有复发性口腔溃疡时，其子女约有62.1％患病，若双亲之一患此病时，其子女约有43.2患病。父母双方均无口腔溃疡的其子女换病率为22.8%.6.微循环障碍：此病甲皱微循环和血液流变学检查有异常，如：毛细血管减少、全血粘度增高、血浆黏度增高、血流流速减慢、毛细血管经脉端管径扩张。

　　7、超氧化物歧化酶活性下降：此病人SOD活性减弱使的体内过氧化物及其自由基增多。

　　8、感染因素：基于细胞学、抗体效价、病毒分离等认为可能与病毒感染或L型链球菌感染有关。

　　9.其他因素：如缺乏微量元素锌、铁、维生素B12、叶酸等的缺乏，或铜、铝的过多，可降低免疫功能，增加复发性口腔溃疡发病的可能性。