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牙周病的许多组织破坏，不是感染微生物直接引起的，而是宿主对感染微生物及其毒性产物的应答间接引起的。机体在阻止微生物入侵或扩散时发生的免疫反应，也会损害局部牙周组织，宿主免疫的保护一破医学`教育网搜集整理坏机制也是牙周病进程的重要环节。
细菌的抗原成分、各种酶、毒素及代谢产物，可直接破坏牙周组织，或引起牙周组织局部的免疫和炎症反应，造成组织损伤。
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