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最常见的体征有口角粘膜苍白和浸软（口角炎），以及唇表面呈朱砂色（唇干裂），继而出现浅表的线状裂纹，愈合时可留下伤疤。这些损伤部位受到白色念珠菌感染时，便产生灰白色高度增生性损害（念珠菌性口角炎）。舌面可呈品红色。皮肤损害常见于鼻唇皱襞，鼻两翼，耳部，眼睑，阴囊及大阴唇处。这些部位变得发红，呈鳞状，而且油脂过多，此外，皮脂堆积在毛囊内，引起皮脂障碍症或鲨鱼皮。
难得有角膜新血管形成及上皮性角膜炎，引起流泪和畏光。营养性弱视用核黄素有效。
尿排出的每克肌酸酐内核黄素＜30μg时可伴随产生核黄素缺乏的临床体征。医学教育`网搜集整理由核黄素引起的红细胞谷胱甘肽还原酶活性增强，是核黄素缺乏的早期体征。
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