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大量资料证实，遗传因素在强直性脊柱炎发病中具有重要作用。有资料显示，强直性脊柱炎是一种多基因的遗传疾病，且与HLA-B27抗原密切关联。经家系调查发现在强直性脊柱炎的第一代亲属中发生该病的危险比一般人群高出20～40倍，孪生子女调查研究更支持这种遗传易感性，在单卵双胎中，一人患病，另一个患病的可能性超过50%.

家族中同患本病者以父子、兄弟最多。据国内流行病学调查，HlA-B27阳性的患者一级亲属患病率为24.2%，比正常人群高出120倍。由于HLA-B27阳性的患者具有家族聚集的倾向，因此对与患者有血缘的亲属及子女应关注其是否有该病的倾向，以便早期检查、早期治疗。