新生儿食管下端括约肌不发达，因而易发生胃食管反流。新生儿胃呈横形，胃的韧带松弛，因此胃容易发生变位、扭转，从而引起呕吐。新生儿胃容量为30～35ml，3个月为150ml，1岁时为250ml。小儿肠管的长度随年龄而不同，成人肠管总长度为身长的4.5倍，新生儿为身长的7～8倍，婴儿为6倍。小儿结肠，尤其乙状结肠和直肠相对地较长，直肠黏膜下层固定较弱，容易造成直肠脱垂。新生儿结肠容积较小，约75ml的钡剂，即可将它充盈。新生儿结肠带和脂肪垂都缺如，结肠袋也不明显。小儿盲肠与阑尾比较游离，活动度大，因而小儿的阑尾位置容易变动。新生儿胎粪总量约100～200g，呈墨绿色。胎粪一般为糊状，偶尔相当稠厚，不能正常排出，形成胎粪塞引起胎粪性便秘。在正常情况下50％新生儿于生后12小时内有胎粪排出，24小时内几乎全部有胎粪排出。2天后转黄色。新生儿服钡后3～6小时达到盲肠，婴儿口服钡剂到排出时间平均为8小时。