常用酒和醋作为辅料如：醋制元胡，但有些小分子的生物碱，季铵碱易溶于水，应少泡多润，尽量减少与水接触的时间，以免生物碱流失。各种生物碱有不同的耐热性，应根据炮制的目的，控制温度和时间医学教`育网搜集整理。如：乌头煎煮时间宜长，马钱子需要控制适宜的加热条件，使士的宁和马钱子碱转变为异士的宁和异马钱子碱等，以保证临床用药安全、有效。再如，石榴皮、龙胆草、山豆根中的生物碱遇热活性降低，应生用。