正畸治疗的生物学基础是颌骨、牙骨质、牙周膜的生物学特性。

一、颌骨的可塑性，颌骨尤其是牙槽骨是人体骨骼中最活跃的部分。颌骨的改建包括增生和吸收两个过程，这是颌骨的重要生理特征，也是正畸治疗的基础，所以矫治过程中颌骨的变化主要是破骨与成骨的平衡的生理过程医`学教育网搜集整理。

二、牙骨质的抗压性，在同一正畸施力条件下往往只有牙槽骨的吸收，却没有或只有少量的牙骨质的吸收。

三、牙周膜内环境的稳定性，正畸矫治完成后经过保持，牙周间的宽度、牙周膜与牙槽骨以及牙骨质的连接都能恢复正常。