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药物在一定的温度和湿度条件下，由于霉菌和酶的催化分解作用，使药物发泡、生衣而制成药曲。具体可根据不同品种，采用不同的方法进行加工处理后，再置温度、湿度适宜的环境中进行发酵。一般温度在30～37℃，相对湿度70%～80%，并借助于微生物和酶的作用。发酵后，气味芳香，无霉气，曲块表面布满黄衣，内部生有斑点。发酵制曲法的关键在于温度和湿度的把握，这对其发酵的速度影响很大。温度过低或过分干燥，发酵会慢甚至不能发酵；温度过高，则会杀死霉菌，不能发酵。通过发酵使药物改变原有的性能，产生新的治疗作用，以扩大用药品种。
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