1.根

苦瓜植株苦瓜根系比较发达，侧根多，主要分布在30-50厘米的耕作层内，根群分布宽达130厘米以上，深30厘米以上。根系喜欢潮湿，又怕雨涝。

2.茎 茎为蔓生，五棱，浓绿色，被茸毛。主蔓各节腋芽活动力强，能发生侧蔓，侧蔓各节腋芽又能发生副侧蔓，形成比较繁茂的蔓叶系统。是瓜类侧蔓较多、较细的一种。各节除腋芽外还有花芽和卷须，卷须单生。

3.叶

苦瓜的叶苦瓜为子叶出土，一般不进行光合作用。初生叶一对，对生，盾形，绿色。以后的真叶为互生，掌状深裂，绿色，叶背淡绿色，叶脉放射状，具五条放射叶脉，叶长16-18厘米，宽18-24厘米，叶柄长9-10厘米，黄绿色，柄有沟。

4.花 花为单性同株。植株一般先发生雄花，后发生雌花，单生。雄花花萼钟形，萼片5片，绿色，花瓣5片，黄色；具长花柄，长10-14厘米，横径0.1-0.2厘米，绿色。雄蕊3枚，分离，具5个花药，各弯曲近S形，互相联合。早晨开花，以6-8时为多。雌花具5瓣，黄色，子房下位，花柄长8-14厘米，横径0.2-0.3厘米，花柄上也有一苞叶，雌蕊柱头5-6裂。

5.果实

苦瓜的果实苦瓜果实为浆果，表面有许多不规则的瘤状突起，果实的形状有纺锤形、短圆锤形、长圆锤形等。麦皮有青绿色、绿白色与白色，成熟时黄色。达到黄熟的果实，顶部极易开裂，露出血红色的瓜瓤，瓤肉内包裹着种子。

6.种子

苦瓜的种子较大，扁平，呈龟甲状，淡黄色，种皮较厚，表面有花纹，每果含有种子20-30粒，千粒重150-180克。每亩种植用种约200-300克。