中医史上第一家官办的药店诞生于宋神宗熙宁九年(公元1076年)，是大名鼎鼎的改革家王安石批准创建的。当时，王安石基于变法派内部分裂，爱子王雯英年早逝，尤其是自己久病缠身，决定辞职而归隐山林。临别政坛，他命人在首都开封创设一家“太医局熟药所”，也叫“买药所”，可以说，它就是现代中药店的前身。

在王安石变法期间，各地曾多次发生自然灾害。他虽然表示“夭变不足畏”，但看到那么多病人痛苦的样子，常常深感不安。尤其是当他得知病者缺医少药，有些人又乘机制造和贩卖假药时，更是百感交集。这时，有人提出建议：应成立一个专门机构，一方面研制一定规格的各种剂型成药，如丸、散、膏、丹，由国家专利出售，不许个人或其他部门私自制作；一方面在水旱疫疠之灾时，给百姓发放药剂。王安石听罢大喜，当即采纳了意见，并组织专门人员落实。

“太医局熟药所”成立后，大大方便了病人，也为政府赢得了丰厚的利润，受到了朝野的一致赞许。所以，王安石变法虽然以失败告终，但“熟药所”的“生意”却一直保持着良好的发展势头。到宋徽宗崇宁二年(公元1103年)，药所已增开到七所。几年后，五所“熟药所”更名为“医药惠民局”，两所“修合药所”更名为“医药和剂局”。与此同时，类似的药局犹如雨后春笋，迅速出现在全国各地。

再后来，由于社会分工的细化，制药和卖药渐渐分离，从而出现了现代意义上的药店，专以卖药为业。

近年来政府规定药店经营必需符合GSP(药品经营质量管理规范)要求,药店的行政主管部门是各级食品药品监督管理局,药店经营必须持有药监局颁发的药品经营许可证,从业人员需持有上岗证