2011年，美国国立卫生研究院（NIH）临床中心的17个病人，发生了血流感染事件，其中6人死亡。医生得知其中一位6月住院的病人携带有克雷伯氏肺炎菌，但是不清楚这种被认为是医院获得性感染一个常见罪魁祸首的细菌，是如何传来传去或是否几个不同的病人简单地感染了该细菌。通过采集病人身上和某些医院设备上的样品，并对不同菌株的基因进行分析，研究人员追踪了该病原体曲折的传播途径。

该项研究发表在《科学转化医学》上，是目前首例全基因组扫描技术在医院暴发疫情期间的应用。

该论文的作者、美国国家人类基因组研究所高级研究人员Julie Segre指出，基因测序技术的应用成为可能，主要是因为其测试成本和速度足以实现近乎实时的测试。2011年每个基因测试的成本为2000美元，2012年已经跌到了500美元。基因扫描结果显示病菌源于1个病人，其他病人通过医院感染该病菌的途径比预计的有所不同，此外现有的医院获得性感染的应对措施还不充分。与流行病学家预计的细菌从第一个病人跳到其他病人身上（此时有迹象表明此病人与第二个病人间发生了血液感染）不一样，细菌的传播方式更加复杂。分析显示，1号病人将细菌分别传给了3、4、8号病人，这些病人在1个多月后出现症状。8号病人身上携带的细菌并未进行进一步的传播。而3号病人携带的细菌传给了5号和2号病人，剩下的病人都是被4号病人所传染。

研究人员认为细菌是通过医院工作人员的手传播。此外，在一个病人使用过的呼吸机上面发现了细菌，这表明常见的清洁程序尚不足以清除掉机器上的细菌。尽管在本次研究中并未发现细菌通过呼吸机传播，但是这种事情可能在其他任何地方发生。