吉林省卫生厅的主要职责是：

　　（一）贯彻执行国家关于卫生工作法律、法规和方针、政策，研究起草地方性卫生法规、规章及政策并组织实施；落实国家卫生事业发展的总体规划和战略目标，研究提出全省卫生事业发展规划，制定社区卫生服务发展规划和服务标准，指导卫生规划的实施。

　　（二）研究提出全省区域卫生规划，统筹规划与协调全省卫生资源配置，指导监督各地区域卫生规划的制定和实施。

　　（三）研究制定全省农村卫生、妇幼卫生工作规划和措施；指导初级卫生保健规划和母婴保健专项技术的实施。

　　（四）贯彻预防为主方针，开展全民健康教育，制定对人群健康危害严重的疾病防治规划，组织对重大疾病的综合防治。

　　（五）研究指导全省医疗卫生机构改革工作；贯彻医务人员执业标准；研究制定并监督实施医疗质量标准和服务规范。

　　（六）依法监督管理血站、单采血浆站的采供血及临床用血质量。

　　（七）研究制定全省重点医学科技、教育发展规划；组织重点医药卫生科研攻关，指导医学科技成果的普及应用和新技术开发。

　　（八）监督管理传染病、地方病防治和食品、职业、环境、放射、学校卫生工作；负责应由卫生部门管理的健康相关产品审批和卫生许可证发放。

　　（九）制定全省卫生人才发展规划；组织实施国家卫生人员职业道德规范；贯彻执行国家卫生机构编制标准和卫生技术人员资格认定标准。

　　（十）组织指导全省医学卫生方面的政府与民间的多边、医学|教育网搜集整理双边合作交流和卫生援外工作；组织参与国际组织倡导的重大卫生活动。

　　（十一）承担省爱国卫生运动委员会日常工作。

　　（十二）负责省委保健委员会确定的保健对象的医疗保健工作；按规定管理省直各部门有关干部的医疗保健工作。

　　（十三）组织调度全省卫生技术力量，对重大突发疫情、病情实施紧急处置，防止和控制疫情、疾病的发生、蔓延。

　　（十四）贯彻落实国家中医药工作的方针、政策和法规；制定全省中医药事业发展规划；推进中医药的继承与创新工作，促进中医药现代化。

　　（十五）承办省政府交办的其他事项。