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肠结核主要位于回盲部，也可累及结肠及直肠。

1.溃疡型肠结核 肠壁病理为干酪样坏死，并形成边缘不规则、深浅不一的溃疡。病灶可累及周围腹膜或邻近肠系膜淋巴结，引起局限性结核性腹膜炎或淋巴结结核。因病变肠段常与周围组织发生粘连，故多不发生急性穿孔，因慢性穿孔而形成腹腔脓肿或肠瘘亦远较克罗恩病少见。

2.增生型肠结核 病变多局限在回盲部，黏膜下层及浆膜层可有大量结核肉芽肿和纤维组织增生，可使肠腔狭窄，引起梗阻。

3.混合型肠结核 兼有上述两种病变。

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