2025年全科主治医师考试的合格标准为每科目达到60分。根据人社部的通知，自2022年度起，全科主治医师考试实行相对固定的合格标准，各科目合格标准为试卷满分的60%。由于全科主治医师考试各科目的满分为100分，因此分数线相对固定为60分。

这意味着考生需要在规定的两年有效期内通过所有四个科目的考试，每个科目单独计算，只要单科成绩达到了60分即为该科目合格。

此合格分数线是全国统一的标准，但对于某些地区，省、自治区、直辖市卫生健康部门可能会根据当地实际情况会同人力资源社会保障部门确定本地区的具体合格标准。因此，考生应关注所在考区的具体通知和要求。

对于特定地区的考生来说，了解并关注所在省份或城市的具体政策非常重要，因为部分地区可能有自己的地区性合格标准，通常会低于60分，具体政策因地区而异。例如，广西乡镇卫生院中级专业技术资格考试各科目合格标准为55分；四川省基层卫生中级专业技术资格考试各科目省定合格标准为55分；新疆维吾尔自治区不同级别的医疗卫生机构有不同的合格标准，从53分到60分不等；贵州省内分数线分为Ⅰ类和Ⅱ类，Ⅰ类分数线为55分，Ⅱ类分数线为50分。

总结来说，全国性的卫生资格考试合格标准是每科60分（满分100分），但部分地区可能会有较低的地方性合格标准。