黏液表皮样癌镜下见，肿瘤实质由黏液细胞、表皮样细胞和中间细胞构成。黏液细胞胞质呈泡沫状或网状，胞核较小，位于基部。表皮样细胞为多边形，细胞核居中，细胞之间可见细胞间桥。中间细胞较小，呈立方状，胞质少，胞核圆形，大小一致，类似于上皮的基底细胞。有时可见透明细胞。根据三种主要细胞成分的比例及细胞分化程度，黏液表皮样癌分为三种类型：①高分化（低度恶性）型：黏液细胞和表皮样细胞为主，占肿瘤细胞的50%以上，中间细胞较少。②低分化（高度恶性）型：构成细胞主要是中间细胞和表皮样细胞，黏液细胞较少，低于10%，散在于表皮样细胞之间。肿瘤细胞异形性及核分裂象明显。③中分化（中度恶性）型：介于上述两型之间。