腰痛是临床各科的常见症状，尿路感染病人也常出现腰痛。肾脏包膜、肾盂和输尿管受到刺激或张力增高时，均可产生疼痛。根据病因、病位、病变性质和程度的不同，临床上可表现出各种腰痛，如钝（胀）痛、剧痛、绞痛、酸痛等。尿路感染病人一般以腰酸痛、钝（胀）痛、剧痛为主，伴有结石时可出现绞痛。急性尿路感染腰痛程度较重，以剧痛、钝痛为主；慢性尿路感染则以腰酸痛常见。一般情况下，下尿路感染不引起腰痛，上尿路感染尤其是伴有肾积水、尿路结石、肾梗阻时，绝大多数有腰痛症状。

肾脏疾病引起的腰痛有特定的压痛部位，可与其它原因引起的腰痛鉴别：①12肋与脊柱成角处；②12肋与腰肌外缘成角处；③肋缘下、腹直肌和肋骨连接外侧；④上输尿管点：腹直肌外缘平脐处；⑤中输尿管点：两髂前上棘连线与通过耻骨结节所作垂线的相交点，相当于输尿管进入骨盆腔处；⑥下输尿管点：中输尿管点下内侧，相当于膀胱输尿管口处。

肾脏疾病所致的腰痛常须与腰肌、脊柱病变所致的腰痛相鉴别。前者除肾脏病变已波及腰肌外，疼痛与腰部活动无关，也不放射到腿部；后者常因腰部运动或体位运动而使腰痛加剧，有时还可放射到下肢，呈坐骨神经痛的表现。可作腰椎x线拍片和其它相应的检查以协助诊断。