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【分享】定量PCR实验技术分享(解答定量问题)

“虽然不知道确切的RNA的浓度,但是做出标准曲线之后可以计算出扩增效率”?请教tgb0yhn,提取的总RNA也可直接做标准品吗?
挥着翅膀的猪 wrote:
楼主你好:
本人是完全的新手,正准备用荧光定量PCR(打算用sybr green染料)测脑中两种酶的表达,导师让我先设计引物,请教楼主:
(1)普通PCR的引物是否可以直接拿来作荧光定量PCR的引物?
(2)以下是我在一篇文献中查到的引物,请帮忙看一下是否可用:
酶1 Sense: catggggaagggaggtaaccag ; Antisense: tcatttatggaggtaagcatc
酶2 Sense: atggctcccgacccggtgccg ; Antisense: ctattggtgaaggtaagcgtc
(3)酶1的上下游引物间约有1200bp,酶2的上下游引物间约有1300bp,这样的距离是不是有可能影响结果啊?
不知到我表达清楚了没,请楼主不吝赐教,拜谢!

普通PCR的引物要看扩增片段大小,如>400BP以上,就不能用于作荧光定量PCR的引物。
酶1上下游引物Tm值相差12℃,而酶2上下游引物Tm值相差21℃,且引物自身有连续4个碱基以上的互补,所以这两对引物不太可用于荧光定量PCR。
楼主好
我刚刚接触荧光定量PCR,我用的是taqman探针法,绝对定量检测病毒含量,我用质粒建立的标准品,我稀释标准品从107~102可每次出来的结果前四个点是一条线且CT值的梯度在3左右。可是后两个点在另一条线。重新稀释又是如此。
希望楼主在百忙之中帮我。谢谢
tgb0yhn,你好!我是新手,刚开始做定量PCR,结果很不好!极度郁闷啊!能否告诉我你的邮箱,请你帮我看看做的结果!我的邮箱是lielieyuyu@yahoo.com.cn谢谢了!
错了,不好意思,邮箱是chongjinghui022@yahoo.com.cn
你好:我准备做血液和肺匀浆的Bcl-2,Bax的定量PCR。我是个初初学者,请问我应该怎样准备实验1.2.3.......?越详细越好!先谢了!
不好意思,我是个新手。请问下real-time PCR 与RT-PCR之间在做法上有哪些不同?我想检测疾病不同时期某蛋白表达的变化是不是前者好些?谢谢!!
现在又发现有实时荧光定量Rt-PCR的叫法, 这种说法对吗?我想他的意思其实就是用荧光定量的方法做Rt-PCR,但能不能这么叫呢?
huangshxcm wrote:
普通PCR的引物要看扩增片段大小,如>400BP以上,就不能用于作荧光定量PCR的引物。
酶1上下游引物Tm值相差12℃,而酶2上下游引物Tm值相差21℃,且引物自身有连续4个碱基以上的互补,所以这两对引物不太可用于荧光定量PCR。


我想请问扩增片段一定要小于400bp吗?我听有些同行说与扩增片段没太大关系的,,到底怎么回事??
我想问问PCR过程中荧光值的大小受什么影响?我做的时候,发现我的曲线最高也超不过500,而同一台PCR仪,别人做曲线经常可以高到4000~5000(X轴数值),这是怎么回事啊.
我们实验室刚开始用real time做半定量PCR,仍旧是对结果的统计方法搞不清楚。我们需要比较两个品种的猪仔同样处理前后,某个基因mRNA的变化(品种间和一个处理前后都要比较),因为无法确定哪个是对照组,因此ddCt法似乎不合适,请问还有没有别的方法?
我们实验室刚开始用real time做半定量PCR,仍旧是对结果的统计方法搞不清楚。我们需要比较两个品种的猪仔同样处理前后,某个基因mRNA的变化(品种间和一个处理前后都要比较),因为无法确定哪个是对照组,因此ddCt法似乎不合适,请问还有没有别的方法?
最近我在一些生物公司的宣传单上看到了"实时荧光定量Rt-PCR",,请问楼主这种说法对吗??
请教一个问题,我做荧光定量时,预实了一次,做出来有标准曲线,昨天就开始做实验,结果标准曲线就没了,不成梯度,除了加样原因,还有可能是什么原因呢,谢谢
这个帖子怎么没人管了 ????
大虾你好:
小弟首次作定量PCR,由于我们所用内参的长度在300bp左右,而我们设计的引物所扩增出来的条带在130bp左右,我想既然是一种确定不同虫期差异表达的相对定量问题,是否可以用该内参做标准曲线?
请大家不吝赐教,不胜感激!
新手,见笑!
版主在哪里???怎么这么多人提问,没人帮忙呢???
我用探针法,这是我的曲线,请帮忙看看怎么样,

1.doc (219.5k)
请教:

我的定量PCR准备使用单标记荧光探针与双链嵌入燃料相结合的方法,供体为Syber-green 1,受体为Cy5,请问在哪个公司可以合成探针?
奇怪都没人回答了
请问知道做real time时,cDNA的浓度最好在什么范围内?
没人管吗?
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