最近在做昆虫肠道微生物多样性的研究，是v3区扩增，我做的是大板，20x20.5,昨天第一次切胶，但是在302nm紫外灯下很难找到目的条带，另外切的时候很可能被外界的大肠杆菌污染，请问怎么才能解决这些问题？谢谢。
先拍照保存,在照片上标记好要切的条带,然后再在紫外下快速切胶."可能被外界的大肠杆菌污染"什么意思?外界只有大肠杆菌吗? 有污染是难免的.但影响不大, 毕竟只是少量的. 我是用去离子水漂洗了几遍胶带的. 另外,条带太暗,回收要困难些.
谢谢楼上的解答,我照相后以最快的速度拿到紫外下切胶，好不 容易切下来，做PCR，再做第二次DGGE,可是跑出来的不是一条带，而是3-4条，做了两次都是这样，不知道怎样才能解决这个问题。
有这种情况的. 可能第一次DGGE胶的条带都没分开. 也可能二次PCR中,有污染发生, 难以避免, 可以增大模板量, 得到缓解.
一般第二次DGGE中应该有一条主带. 如果是这样可以减少上样量.
