导致同种异体免疫排斥反应的主要原因是供j；受者之间主要组织相容性抗原（major histocompatibility antigen，MHC）的不同。另外，次要组织相容性抗原（minor histocompatibility antigen，mHC）、ABO血型抗原、组织特异性抗原等，在同种移植免疫反应中亦起着一定的作用。引起免疫应答的供者移植物抗原称为移植抗原。

　　主要组织相容性抗原：组织相容性是指不同个体问进行组织器官移植时，供者和受者双方相互接受的程度。编码最强移植抗原的基因座位即为主要组织相容性复合体（MHC），其编码的抗原即为主要组织相容性抗原。MHC主要表达在细胞膜表面，是引发同种移植排斥反应的最芷要的抗原。在人类，编码主要组织相容性抗原的MHC位于6号染色体短臂，其产物为MHC分子，又称人类白细胞抗原（HLA），包括MHC.I类、Ⅱ类分子。

　　MHC-I类分子（HLA_A、B、C）表达于所有的有核细胞表面，而MHGⅡ类分子（HLA- DR、DQ、DP）通常只表达于专职抗原递呈细胞（profession antigen presenting cell，PAPC）：表面，如树突状细胞（dendritic cell，DC）、巨噬细胞（macrophage）及活化的8细胞和T细胞，也可表达于内皮细胞表面。MHC具有广泛的多态性，这就使得HLA分子能够结合无数的抗原肽，并引起同种移植免疫反应。

　　由于HLA  I、Ⅱ类分子抗原结合部位空间结构上的差异，其结合的抗原类型也是不同的。

　　HLA_ I类分子通常结合细胞自身合成的抗原，即内源性抗原；HLAIII类分子主要结烩外来抗原。HLA-I类分子主要将内源性抗原肽和病毒抗原递呈给CD8细胞毒性T细胞（CTL），而HLA-Ⅱ类分子主要递呈外来抗原肽给CD4辅助性T细胞（Th）。