病毒呈球形，直径约为27nm.无囊膜。衣壳由60个壳微粒组成，呈20面体立体对称，有HAV的特异性抗原（HAVAg），每一壳微粒由4种不同的多肽即VP1、VP2、VP3和VP4所组成。

在病毒的核心部位，为单股正链RNA.除决定病毒的遗传特性外，兼具信使RNA的功能，并有传染性。

HAV的单股RNA，其长度相当于7400个核苷酸。在RNA的3′末端有多聚的腺苷序列，在5′末端以共价形式连接一由病毒基因编码的细小蛋白质，称病毒基因组蛋白（Viral protein ，genomic，VPG）。

它在病毒复制过程中，能使病毒核酸附着于宿主细胞的核蛋白体上进行病毒蛋白质的生物合成。

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