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对于AIDS的患者，主要病变是发生继发性感染疾病，即机会性感染。这些机会性感染是由于对在正常情况下存在并可控制的病原体的失控所造成的，一般包括：卡氏肺囊虫病引起的肺炎、结核分枝杆菌或胞内分枝杆菌引起的结核、慢性隐孢子虫病、弓形虫病、病毒性感染（如巨细胞病毒）。继发性癌变如卡波齐氏（kaposis）肉瘤和非何杰金氏（nonhodgkins）淋巴瘤是另一种有时可在AIDS患者中发现的继发性病变。这些癌变通常具有侵袭性，并对标准化疗的反应不理想。一般的，卡波齐氏（kaposis）肉瘤是发现于老年男子中的一种良性肿瘤，对机体无严重的不利影响。但是，在非洲AIDS患者中发现的卡波齐氏（kaposis）肉瘤是一种快速生长、通常致命性的恶性肿瘤。在世界上许多地方，AIDS相关综合征（ARC）或AIDS患者仅简单地表现为严重地腹泻。

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